Фамилия Гандюрин — редкая, и её разбор требует внимания к деталям. В первую очередь бросается в глаза суффикс -ин, который в русской ономастике обычно указывает на происхождение от имени или прозвища матери (так называемые «матримониальные» фамилии) либо от существительного женского рода, оканчивающегося на -а/-я. Основа «Гандюр-» здесь явно восходит к прозвищу Гандюра.

Само прозвище Гандюра — тёмное, неочевидное. Вероятнее всего, оно связано с диалектным словом «гандырь» или «гандюр». В южнорусских и украинских говорах так могли называть драчуна, задиру, буяна (от «гандырить» — ссориться, задирать). Есть и более прозаичная версия: в некоторых областях «гандюрой» называли неуклюжего, неловкого человека или того, кто ходит вразвалку. В любом случае, прозвище носило бытовой характер и давалось по поведению или внешности.

Менее вероятна, но допустима связь с личным именем. В старину существовало редкое каноническое имя Геннадий, которое в народе могли переделывать в «Гандя» или «Гандюра» (по аналогии с «Авдей — Авдюра», «Фадей — Фадюра»). Однако для этого нет надёжных исторических подтверждений — фамилия Гандюрин не фиксируется в массовых списках дворянства или купечества, а значит, её носители были, скорее всего, крестьянами или мещанами.

Интересна и модель образования. Фамилии на -ин от основ на -а (Гандюра → Гандюрин) типичны для северных и центральных областей России, в то время как на юге и в Украине чаще использовали суффикс -енко (Гандюренко). Если Гандюрин встречается в документах, скажем, из Рязанской, Тамбовской или Нижегородской губерний, это подтвердит именно русское, а не украинское происхождение фамилии.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Гандырин, Гандурин) показывает, что корень мог колебаться в написании из-за местного произношения: «а» вместо «о» (аканье) или замена «ы» на «ю». Поэтому Гандюрин мог быть вариантом более распространённой фамилии Гандырин, где основа «гандырь» — тот же драчун или смутьян. Но если ваша фамилия пишется именно через «ю», это, скорее всего, устойчивый местный вариант, закрепившийся в одном роду.

В итоге: предок носителя фамилии Гандюрин в XVI–XVII веках получил прозвище Гандюра за неуживчивый характер или неловкость. Фамилия закрепилась в среде крестьян или посадских людей, а её редкость говорит о том, что род был немногочисленным и не разросся в целую «фамильную деревню».