Фамилия Гандурина — яркий пример того, как прозвище, данное человеку по характерной черте, превратилось в родовое имя. В её основе лежит слово «гандура» или «гандур». В южнорусских и украинских говорах так называли вялого, медлительного, а иногда и неуклюжего человека. Слово имеет явную экспрессивную окраску, близкую к «гандобить» (мять, портить) или «ганджа» (неуклюжий, нерасторопный). Таким образом, первый носитель прозвища Гандура, скорее всего, выделялся в своей среде неспешностью или неловкостью.

Модель образования фамилии — патронимическая, с помощью суффикса -ин. Фамилии на -ин в русской традиции указывали на принадлежность к роду: «чей?» — Гандурин, то есть сын или потомок Гандуры. Окончание -а в исходном прозвище (Гандура) и последующее -ин — классическая схема для фамилий, образованных от существительных мужского рода с окончанием на -а/-я. Это отличает её, например, от фамилии Гандуров, где основа — Гандур (слово мужского рода, давшее суффикс -ов).

Географически фамилия тяготеет к югу России, особенно к Ростовской области, Краснодарскому краю, а также к Украине. Встречается и в Поволжье, но значительно реже. В дореволюционных переписях носители фамилии чаще всего числились крестьянами или мещанами. Сословная элита среди Гандуриных — редкость, что подтверждает народное, прозвищное происхождение.

Примечательно, что в некоторых диалектах слово «гандура» могло иметь и иное, неожиданное значение — так иногда называли особый сорт крупной груши или тыквы. В этом случае прозвище могло быть дано человеку за внешнее сходство с плодом (например, за полноту или особую форму). Эта версия менее распространена, но не исключена, особенно в сёлах, где огородничество было основным занятием. Однако первая версия — от черт характера — остаётся основной, так как прозвища по поведению встречаются в ономастике гораздо чаще, чем по овощам.