Фамилия Гандюрина — женская форма, мужская — Гандюрин. В основе, скорее всего, лежит прозвище или мирское имя Гандюра. Здесь мы сталкиваемся с редкой словообразовательной моделью: суффикс -юр-/-ур- встречается в русских фамилиях нечасто и обычно указывает на южнорусское или украинское влияние. Сравните с фамилиями Кандюрин, Мандюрин — все они образованы по одному типу, что говорит о региональной, а не случайной природе такого окончания.

Само слово «гандюра» в диалектах не зафиксировано, но можно предположить его связь с глаголом «ганять» (гнать, понукать) или с украинским «ганьба» (позор, бесчестье). Однако более вероятна версия, что Гандюра — это вариант крестильного имени Андрей или Евдоким, прошедший через народную переработку. В южнорусских говорах начальное «а» нередко переходило в «га» (гавтомобиль, гакация), а суффикс -юр- мог добавиться для уменьшительности. Таким образом, Гандюра могло быть домашней формой имени Андрей, а фамилия Гандюрин означала «сын Гандюры».

Географически фамилия тяготеет к Курской, Белгородской и Воронежской областям, а также к восточным районам Украины — именно там встречаются носители. Сословного барьера у фамилии не было: Гандюрины могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками. В документах XVIII–XIX веков такая фамилия почти не встречается, что указывает на её позднее оформление — скорее всего, вторая половина XIX века, когда фамилии активно закреплялись за бывшими государственными крестьянами.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Гандюрин стоит особняком: Гандин, Ганюшкин, Гандюков — все они образованы от разных основ, но объединены общим корнем «ган-». Именно редкий суффикс -юр- делает фамилию Гандюрина узнаваемой и не даёт спутать её с более распространёнными Гандиными или Ганюшкиными.