Фамилия Ганебных — одна из тех, что сразу обращает на себя внимание необычным окончанием. Она принадлежит к северному, архангельско-вятскому типу фамилий на -их/-ых, которые застыли в форме родительного или предложного падежа множественного числа. В отличие от центральнорусских фамилий на -ов/-ев («чей?»), фамилии на -их отвечали на вопрос «из чьих?» или «где живущих?». Так, Ганебных — это «из семьи Ганебного» или «из дома Ганебных».

Корень фамилии — ганеб- — напрямую связан со словом «ганебный», которое в старых русских говорах означало «позорный, постыдный, бесчестный». В словаре В. И. Даля «ганеба» — это позор, срам, а «ганебный» — позорящий. На первый взгляд, основа кажется обидной. Но в крестьянской среде прозвища часто давались «от противного» — как оберег, чтобы злые силы не позарились на ребёнка. Ганебным могли назвать младенца, желая ему счастливой и честной жизни: мол, раз имя плохое, то и судьба будет хорошей. Либо прозвище закреплялось за взрослым человеком с резким, сварливым характером, который «срамит» семью, — но в таком случае оно могло передаваться по наследству уже без негативного оттенка.

Есть и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от географического названия. В центральной России встречаются урочища и овраги с корнем «ганеб-», например, овраг Ганебный в бывшей Тамбовской губернии. Жителей такого места называли «ганебные», а их потомков — «Ганебных». Однако эта версия менее вероятна, так как фамилия редкая и не имеет широкого «гнезда» однокоренных сел.

Исторически фамилия Ганебных — почти наверняка крестьянская или мещанская. В дворянскую среду такие «бытовые» прозвища на -их не проникали: дворянство предпочитало фамилии на -ский или -ов, образованные от вотчин и личных имён. В метрических книгах XIX века Ганебных чаще всего встречаются в Вятской и Пермской губерниях, а также среди старообрядцев Урала. Это подтверждает северное происхождение: именно в этих регионах фамилии на -их держались дольше всего, вплоть до XX века, и не переделывались под общерусский стандарт.

С точки зрения словообразования фамилия уникальна: суффикс -н- в основе («ганеб-н-ых») указывает на прилагательное, а не на существительное. Это отличает её от большинства фамилий на -их, образованных от личных имён (Иванов → Ивановых). Здесь основа — качественное прилагательное, что встречается редко. Поэтому Ганебных — фамилия не просто редкая, а выделяющаяся даже среди северных «выходцев»: она несёт в себе и древнюю обережную традицию, и диалектную лексику, и чёткую региональную привязку.