Фамилия Ганецкий звучит по-польски, и это не случайно. Её основа — имя Ганя, которое в славянских языках является уменьшительной формой от нескольких крестильных имён: Иоанн (через польское Jan), Гавриил или даже Агафон. Суффикс -ецкий (в польском варианте -ecki) указывает на дворянское или шляхетское происхождение: в Речи Посполитой такие фамилии чаще всего получали владельцы поместий, и означали они «из такого-то места» или «принадлежащий к роду такого-то». Соответственно, Ганецкий — это либо «сын Гани», либо человек из населённого пункта с названием вроде Ганцы или Ганьки.

Есть и вторая, менее очевидная версия, которую поддерживает польская ономастика. В некоторых говорах «ганя» могло означать «горшок» или «кувшин» — слово того же корня, что и «гончар». В этом случае родоначальник мог быть гончаром, а фамилию дали по ремеслу, но уже в готовой модели на -ский, что для простого сословия в Польше было редкостью. Поэтому версия с именем Ганя (как производным от Яна) выглядит правдоподобнее: она объясняет и широкую географию фамилии, и её «шляхетскую» огласовку.

На территории бывшей Российской империи фамилия Ганецкий встречается преимущественно в западных губерниях — на землях, которые входили в состав Речи Посполитой. После разделов Польши многие носители фамилии перешли на русскую службу, и это объясняет, почему Ганецкие попали в списки русского дворянства. Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа Ган- + типичный для польской знати суффикс -ецкий, который в русской передаче закрепился как -цкий, а не -ский (сравните с фамилиями Потоцкий, Замойский, хотя по-польски они звучали бы как Potocki, Zamoyski). Фамилия довольно редкая, и её носители, скорее всего, ведут род из мелкопоместной шляхты или из горожан, получивших фамилию по отцу-«Гане».