По одной из версий, фамилия Ганя происходит от прозвища Ганя из нарицательного «гана» (в переводе с украинского – «осуждение»). Возможно, предок обладателя этой фамилии вел образ жизни, в чем-то отличный от общепринятого, за что его и осуждали односельчане. Согласно другой, более правдоподобной гипотезе, фамилия Ганя была образована от имени Гавриил. В основе фамилии лежит его уменьшительная форма – Ганя. Само имя Гавриил имеет древнееврейские корни, а на русский переводится как «божественный воин».