Фамилия Гапилов предположительно образована от личного имени Гапил, которое, скорее всего, является диалектным вариантом арабского имени Гафил, что значит «беспечный». Менее вероятно, что фамилия Гапилов образована от кавказского прозвища Гапил, которое этимологически связано с черкесским словом «гъуаплъэ» - «медь». В этом случае прозвище Гапил относится к профессиональным именованиям и указывает на род занятий предка: он мог быть медником — мастером, занимавшимся изготовлением или починкой медных изделий, посуды.