Фамилия Гаписова — редкий случай, когда очевидная, на первый взгляд, основа ставит перед исследователем больше вопросов, чем даёт ответов. Словообразовательная модель стандартна: суффикс -ов- указывает на принадлежность (чей сын? — Гаписов), а окончание -а — на женскую форму. Но что стоит в корне?

Самая правдоподобная версия отсылает к личному имени Гапис. Это имя — один из вариантов крестильного имени Агапий (от греческого «агапе» — любовь). В русской народной традиции полногласные имена часто усекались: Агапий превращался в Гапа, а от него уже образовывалась фамилия Гапов. Форма Гапис могла возникнуть под влиянием других имён на -ис (например, Анис), либо как диалектное произношение. Тогда Гаписов — буквально «сын Гаписа», то есть потомок человека, которого в быту звали Гаписом.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с прозвищем Гаписа. В южнорусских и украинских говорах «гапка», «гапити» могли означать нечто, связанное с зеванием или разинутым ртом (сравните с «гапать» — хватать ртом воздух). Однако прозвищная основа для фамилии на -ов типична, но в данном случае лингвистически менее обоснована, чем имя.

Географически фамилия Гаписова встречается разрозненно, без выраженного «гнезда», что характерно для фамилий от редких канонических имён. Носители могли быть из разных сословий, но, судя по характеру окончания (не -ский), фамилия скорее крестьянская или мещанская, а не дворянская.

В написании фамилии есть одна особенность: ударение, скорее всего, падает на второй слог — Га́писова, хотя возможен и вариант Гапи́сова, если исходное имя произносили с ударением на последний слог. Точных данных об известных исторических носителях нет, что подтверждает: перед нами редкая, семейная фамилия, сохранившая в себе память об уменьшительной форме старинного имени.