Фамилия Гаракишиев — редкий случай, когда географическое происхождение почти очевидно, а вот с корнем нужно разбираться. Она явно тюркская и, скорее всего, образована от имени Гаракиши. В азербайджанском и некоторых других тюркских языках «гара» означает «чёрный», а «киши» — «человек» или «мужчина». То есть Гаракиши — это «чёрный человек». В именах тюркских народов компонент «чёрный» (кара/гара) часто не указывал на цвет кожи, а обозначал силу, суровость, простоту или, наоборот, был оберегом от злых духов — чтобы ребёнка не сглазили, называли «чёрным», то есть незаметным для нечистой силы. Так что в основе лежит личное имя-прозвище Гаракиши, которое давали, скорее всего, крепкому, смуглому или просто серьёзному мужчине.

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность. В русской традиции оформления фамилий у тюркских народов Кавказа и Закавказья (азербайджанцев, лезгин, татов) суффикс -ев/-ов стал стандартным способом русификации. Фамилия Гаракишиев буквально значит «сын Гаракиши» или «из рода Гаракиши». Интересно, что в самом азербайджанском языке такая фамилия звучала бы как Гаракишиев или, в более тюркизированной форме, Гаракишили. Вариант с «-ев» закрепился именно через русское делопроизводство, особенно в XIX — начале XX века, когда фиксировались фамилии сельских жителей.

По сословной принадлежности предки носителя фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками из регионов с преобладанием азербайджанского населения — это Ширван, Карабах, Куба, а также южный Дагестан (Дербентский район). Редкость фамилии говорит о том, что родоначальник был фигурой локальной, а не разветвлённого знатного рода. Встречаются также формы Гаракишиев, Гара-Кишиев, но написание через «а» — основное. Сегодня фамилия распространена в Азербайджане, Дагестане и среди диаспоры, но остаётся малочисленной, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска — круг возможных родственников узок, и восстановить родословную по устным преданиям проще, чем по массовым фамилиям.