Фамилия Гардиеня — редкая и неочевидная для русского уха. Её форма сразу подсказывает, что перед нами не типичная русская фамилия на -ов, -ев или -ин. Окончание -еня характерно для белорусской и западноукраинской ономастики. В белорусском языке суффикс -еня часто образует фамилии от личных имён или прозвищ, придавая им оттенок уменьшительности или принадлежности (ср. Гардзиеня, Радзивоненя). Таким образом, географически фамилия тяготеет к территории современной Беларуси или западных областей Украины.

Основа фамилии — Гарди- — скорее всего, восходит к имени или прозвищу Гардя. Это мог быть вариант крестильного имени Гордей (от греческого «гордиас» — «царь» или, по другой версии, «грозный»). В народной речи имя Гордей нередко упрощалось до Гардя или Гардик, особенно в диалектах, где «о» в безударном положении переходило в «а» (аканье). Фамилия Гардиеня буквально означала «сын (или потомок) Гарди» или «маленький Гардя».

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с польским словом «gardy» — «гордый» или с тюркским именем Гарди (встречается у народов Поволжья). Однако для фамилии с белорусским суффиксом первая версия — от имени Гордей — выглядит убедительнее. Фонетически переход «Гордей» в «Гардя» обычен для простонародной речи, а суффикс -еня закрепляет эту форму как фамильное прозвище.

Носители фамилии Гардиеня, скорее всего, были крестьянами или мещанами из западных губерний Российской империи. Фамилия не принадлежала дворянским родам — такие модели словообразования типичны для непривилегированных сословий, где фамилии часто закреплялись по отцу или по прозвищу без дополнительных суффиксов принадлежности. В современных базах данных фамилия встречается единично, в основном в Беларуси и среди выходцев оттуда. Это редкое, но выразительное свидетельство народной белорусской традиции именования.