Фамилия Гавнюшко звучит резко для современного уха, но за ней стоит обычная для восточнославянской ономастики история. Основа здесь — корень «гавн-», который в древнерусском языке означал «кал, нечистоты». Прозвище Гавня, Гавнюк или Гавнюш мог получить человек, работавший с навозом (крестьянин, удобрявший поля, или скотник), либо же, что в народе встречалось часто, — неопрятный, неряшливый человек. Такие «неблагозвучные» прозвища давали не столько для оскорбления, сколько как оберег от сглаза или по принципу «от противного».

Суффикс -ко в фамилии Гавнюшко — типичный для украинских и белорусских фамилий. Он выполняет функцию уменьшительности или принадлежности: Гавнюшко — это буквально «маленький Гавнюк» или «сын Гавнюка». Подобная модель (основа + -ко) распространена на Правобережной Украине, в Подолье и на юге Беларуси. Встречаются и родственные формы: Гавнюков (русифицированный вариант с суффиксом -ов), Гавнюк, Гавнич.

Споров вокруг происхождения фамилии почти нет: корень прозрачен, хотя в современных говорах слово «гавно» стало грубым ругательством. В старину оно было нейтральным бытовым термином. Сравните с фамилиями Дерюгин (от «дерьмо»), Сракин или Калугин (от «кал»). Все они образованы по одной логике — от прозвищ, связанных с грязью или отходами жизнедеятельности. Никакой мистики или дворянских корней здесь нет: Гавнюшко — фамилия крестьянская или мещанская, чаще всего записанная на территории современной Украины.

Встречаемость фамилии невысокая. По открытым данным, основная масса носителей сосредоточена в западных и центральных областях Украины (Винницкая, Хмельницкая, Житомирская области), а также в приграничных районах Беларуси. В России фамилия редка и обычно принадлежит потомкам переселенцев с Украины. Единственная особенность, которую стоит отметить: из-за неблагозвучности в советское время некоторые носители меняли фамилию на Гаврюшко (от имени Гавриил) или Гаврилов, что затрудняет поиск исторических корней.