Фамилия Гайдуллин образовано от имени Гайдулла, которое происходит из арабского языка, где имеет значение «принадлежащий Аллаху, поклоняющийся Аллаху». Таким образом, потомок человека, которого звали Гайдулла, со временем получил фамилию Гайдуллин.