Фамилия Гайдулины — один из тех родовых имен, которые ведут свою историю от личного имени, а не от прозвища или профессии. В основе лежит арабское имя Гайдулла (встречается и форма Гайдуллах), которое переводится как «принадлежащий Аллаху», «поклоняющийся Аллаху». Это имя образовано от арабского слова «гайд» (или «гайд-»), связанного с понятием служения и верности, и «Аллах» — имя Бога в исламе. Такие имена — часть широкой традиции мусульманского именослова, где к основе добавляется «-улла» или «-алла», подчеркивающая связь человека с Всевышним (сравните с именами Абдулла, Убайдулла).

Фамилия Гайдулин — это вариант более распространенной фамилии Гайдуллин. Разница в написании (с одним или двумя «л») — явление обычное для русской адаптации тюркских и арабских имен, особенно на стыке XIX–XX веков, когда фамилии активно фиксировались в документах. Один «л» в суффиксе мог появиться из-за упрощения произношения в русской среде или из-за ошибки писаря. Оба варианта восходят к одному корню и означают одно и то же: «потомок Гайдуллы».

Фамилия Гайдулины, как и Гайдуллины, распространена в среде татар, башкир, а также у других народов Поволжья и Приуралья, традиционно исповедующих ислам. Встречается она и у казахов. География бытования фамилии — преимущественно регионы с компактным проживанием этих народов: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Самарская, Челябинская области.

Форма Гайдулин (с окончанием -ин) указывает на принадлежность: «чей?» — Гайдулин, то есть сын или потомок человека по имени Гайдула. В русском языке суффикс -ин — стандартный способ образования притяжательных прилагательных и фамилий от основ на -а, -я. Поэтому фамилия Гайдулин органично вписалась в русскую фамильную систему, сохранив восточную основу.

Точное время появления фамилии у конкретной семьи назвать сложно: процесс перехода от отчества к наследственной фамилии у тюркских народов России растянулся на несколько столетий и завершился в основном к началу XX века. Достоверное установление родословной требует обращения к архивным метрическим книгам и ревизским сказкам.