Фамилия Гайназаров — тюркская по происхождению, и её разбор лучше всего начать с личного имени, лёгшего в основу. Первая часть «Гайн» (или «Гайни») восходит к арабскому слову «гайн» (غين), которое в тюркских языках, особенно у башкир и татар, означает «богатство», «драгоценность», «сокровище». Вторая часть — «азар» — это тюркский именной компонент со значением «мужественный», «решительный», «дерзкий». Таким образом, имя Гайназар в буквальном смысле можно перевести как «драгоценная смелость» или «богатырь-сокровище».

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий, которая в XIX–XX веках закрепилась у многих тюркских народов, входивших в состав Российской империи. В отличие от исконно русских фамилий на -ов, где суффикс присоединялся к прозвищу или отчеству, здесь он механически добавлен к готовому мусульманскому имени. Если бы фамилия сохранила исконную тюркскую форму, она звучала бы как Гайназар улы (у башкир) или Гайназар оглы (у азербайджанцев). Именно по суффиксу -ов можно определить, что фамилия оформилась в среде, где делопроизводство велось на русском языке — скорее всего, у башкир, татар или народов Северного Кавказа.

Географически фамилия Гайназаров наиболее распространена в Башкортостане и соседних регионах — Оренбургской, Челябинской областях. Встречается она и у татар, но реже. В башкирском именослове имя Гайназар считается традиционным, и его носили не только простые люди, но и религиозные деятели. В дореволюционных метрических книгах можно найти записи о Гайназарах из числа тептярей и башкир-вотчинников — сословий, которые не были крепостными и имели земельные права. Это важная деталь: предки носителей фамилии, скорее всего, были свободными земледельцами или скотоводами, а не крестьянами, закрепощёнными помещиками.

Стоит упомянуть и редкую особенность написания. Встречаются варианты Гайназаров и Гайназаров — с ударением на второй или третий слог. В башкирском языке ударение обычно падает на последний слог, поэтому в быту фамилия часто произносится как Гайназарóв, хотя в русской канцелярской традиции закрепился вариант с ударением на «а» (Гайназáров). Это типичный для тюркских фамилий случай, когда устная и письменная нормы расходятся.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Гайназаров стоит в одном ряду с Гайнизяновым (от Гайнизян — «богатство души»), Гайнуллиным (от Гайнулла — «богатство Аллаха») и Гайфуллиным. Все они образованы от имён с корнем «гайн», но каждый раз с разным вторым компонентом. Фамилия Гайназаров выделяется среди них именно «мужественным» значением второй части — она говорит не о религиозном или духовном качестве, а о личной храбрости и силе предка.