Фамилия Гайнуллаев — один из ярких примеров того, как русская письменная традиция закрепила мусульманское имя. Её основа — арабское теофорное имя Гайнулла (Гайнуллах), где «Гайн» означает «богатство», «изобилие», а «Аллах» — Бог. Вместе имя переводится как «богатство Аллаха» или «дар Божий». В исламской среде это распространённое имя, которое давали в знак благодарности Всевышнему.

Словообразовательная модель фамилии — тюркская по происхождению, но оформленная по русскому образцу. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного) указывает на принадлежность: «сын Гайнуллы». Такая модель типична для фамилий, возникших у татар, башкир, казахов и других народов Поволжья и Урала, которые в XIX–XX веках массово получали русские паспорта и записывали фамилии по патронимическому принципу. То есть Гайнуллаев — это буквально «Гайнуллаев сын».

В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образуются от основ на -а/-я, здесь сработал более редкий для тюркских имён суффикс -ев: имя Гайнулла заканчивается на гласный, но в русской канцелярской практике его восприняли как основу, требующую именно такого суффикса. Сравните с однокоренными фамилиями Гайнуллин (от Гайнулла с суффиксом -ин) или Гайнулов (усечённая форма). Каждый из этих вариантов встречается в разных регионах, но Гайнуллаев чаще фиксируется у татар и башкир, где имя сохранило полную форму.

Социальный контекст: носители фамилии — потомки людей, носивших имя Гайнулла. Скорее всего, предки были крестьянами или ремесленниками, так как фамилии такого типа в татарской и башкирской среде не указывали на сословие, а лишь фиксировали родовое имя. Дворянских корней у фамилии нет — в России мусульманская знать обычно получала фамилии на -ский или -ев с более сложной этимологией.

Встречается фамилия в основном в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, реже — в Средней Азии, куда фамилия попала с переселенцами. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Гайнулла́ев, хотя в бытовой речи возможны варианты.