Фамилия Гендлина в своей основе, скорее всего, имеет не русское, а еврейское происхождение, о чём говорит характерное окончание и корень. В отличие от типичных русских фамилий на -ин, образованных от прозвищ или профессий, Гендлина восходит к личному имени Гендель — уменьшительной форме древнееврейского имени Гдалья (в ашкеназском произношении — Гдалье), что означает «велик Господь». Имя было популярно в еврейской среде Восточной Европы, а суффикс -ин в данном случае выступает не как русский патронимический показатель, а как адаптированное окончание, привнесённое при русификации фамилий в Российской империи в XIX веке.

Словообразовательная модель здесь нестандартна: если бы фамилия была чисто русской, её следовало бы ожидать в форме Генделев (от имени Гендель). Однако окончание -ин указывает на то, что носители фамилии жили в регионах, где малороссийское или польское влияние смешивалось с русским, и фамилию записывали по аналогии с женскими формами (например, «чей? — Гендлин»). Встречается и вариант Гендельман, где суффикс -ман (человек) прямо указывает на происхождение: «человек по имени Гендель» или «человек из рода Генделя».

Географически фамилия Гендлина чаще всего встречается в записях из черты оседлости — на территории современной Украины, Беларуси и Молдовы, а также в центральных губерниях России, куда еврейское население переселялось после реформ. В дореволюционных метрических книгах можно найти упоминания Гендлиных среди мещан и купцов, что типично для еврейских фамилий, образованных от имён: они не несли сословной окраски, а просто фиксировали родство.

Примечательно, что фамилия почти не имеет однокоренных аналогов в славянской ономастике. Случайное совпадение с немецким словом Gendel (от Gendarm — жандарм) маловероятно, так как для русских фамилий такая основа нехарактерна. Таким образом, Гендлина — это типичный пример ашкеназской фамилии, адаптированной через русский суффикс, и её носители, скорее всего, вели происхождение от человека по имени Гендель, жившего в местечках Юго-Западного края.