Фамилия Герматко образована от имени Гермат — западнославянского варианта библейского имени Иеремия. В переводе с древнееврейского оно означает «возвышенный, возвеличенный, вознесенный Богом». Святой покровитель имени — ветхозаветный пророк Иеремия, которого почитают как предтечу Мессии. Такая модель типична для фамилий на -ко, распространённых на западнославянских землях, особенно в украинской и белорусской традициях, где суффикс -ко часто присоединяли к крестильным именам, указывая на потомка.

Менее вероятна версия, что в основе лежит прозвище Гермат, восходящее к венгерскому слову gyarmat — «колония». В этом случае родоначальника могли прозвать колонистом, переселенцем. Однако эта гипотеза уступает первой по убедительности: венгерское заимствование в славянской среде встречается реже, чем адаптация библейского имени, а суффикс -ко нехарактерен для венгерской ономастики. Так что потомка человека по имени Гермат скорее всего нарекли Герматко — и фамилия закрепилась за родом.