Фамилия Гержот — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, собирают из двух немецких корней, причём один из них морской, а другой — военный. Первая часть, Ger, переводится как «метательное копьё» или «дротик». Вторая часть, Schot, — это «шкот», то есть морская снасть, верёвка, которой управляют парусом. Соединение «копьё» и «снасть» звучит неожиданно, но именно такая составная модель даёт ключ к разгадке: перед нами, скорее всего, прозвище, а не географическое название или патроним.

Словообразовательная форма фамилии — чистая основа без русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что для славянских фамилий нетипично. Это намекает либо на позднее заимствование, либо на то, что фамилию зафиксировали в документах с чужого голоса, не адаптировав под местные модели. В русском языке фамилии на -от встречаются крайне редко и почти всегда имеют иноязычные корни (сравните с польскими или немецкими фамилиями на -ot).

По смыслу прозвище указывает на род занятий. «Метательное копьё» могло относиться к охотнику или рыбаку, который бил рыбу острогой, а «шкот» — уже прямая отсылка к парусному делу. Вместе эти понятия рисуют портрет человека, связанного с морем или большой рекой: возможно, он промышлял рыбу гарпуном на небольшом судне, где сам управлял снастями. Версия о рыболовстве выглядит правдоподобнее, чем о военном деле, — слишком уж конкретна морская терминология.

Географически фамилия могла возникнуть в местах, где пересекались немецкая и славянская речь: Прибалтика, бывшие ганзейские города, Поморье. Там немецкие ремесленники и рыбаки нередко получали прозвища по орудиям труда, а потом их потомки выходили в русскую среду. В современных русских фамильных списках Гержот встречается единично, что подтверждает его локальное и, вероятно, позднее происхождение.