Фамилия Гилунов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, корень «гилун», не встречается ни в древнерусских именах, ни в распространённых ремёслах. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно разобрать её по составу и обратиться к диалектам и заимствованиям.

Фамилия образована по типичной русской модели: к основе «Гилун» добавлен патронимический суффикс «-ов», означающий «сын» или «принадлежащий». Центральный вопрос — что такое «Гилун». Скорее всего, это прозвище. В русских говорах слово «гилун» или «гиля» могло означать «крикун», «горлопан» или «плакса» (от глагола «гилить» — кричать, плакать). В таком случае предок получил прозвище за громкий голос, беспокойный нрав или особенность речи.

Есть и другая, менее очевидная версия, связанная с географией. Фамилия могла возникнуть на стыке славянских и тюркских языков, например, в Поволжье или на Урале. В некоторых тюркских наречиях корень «гил» может означать «глина» или «ил» — тогда «Гилун» — это человек, живший на глинистой почве или работавший с глиной (гончар). Однако это предположение требует дополнительных данных о конкретном регионе бытования фамилии.

Известных носителей фамилии в истории и культуре зафиксировано мало, что типично для редких фамилий, не попавших в дворянские родословные книги. С уверенностью можно сказать лишь то, что фамилия Гилунов — русская по форме, а её основа, прозвищная или диалектная, отражает либо характер, либо род занятий далёкого предка.