Фамилия Гиненко — яркий пример украинской фамилии, образованной при помощи патронимического суффикса -енко. Эта модель была самой распространённой в Левобережной и Степной Украине в XVII–XVIII веках. Суффикс -енко буквально означал «маленький» или «сын», так что изначально Гиненко — это «сын Гини» или «потомок Гини». То, что перед нами именно украинская, а не русская или белорусская фамилия, видно по суффиксу: если бы фамилия закреплялась в центральной России, она скорее получила бы окончание -ов (Гинин).

Ключевой вопрос — что такое «Гина». Это краткая разговорная форма от полного канонического имени. Скорее всего, в основе лежит имя Евгений (от греческого «благородный»), которое в быту сокращали до Гена, а затем до Гина. Такой путь через чередование звуков — не редкость: Евгений — Гена — Гина. Менее вероятно, но возможно происхождение от имени Геннадий (тоже греческое, «благороднорождённый») или от редкого имени Иннокентий (с усечением первого слога). В любом случае, все версии ведут к крестильным именам, популярным среди духовенства и мещанства.

Встречается версия, что Гиненко могло быть прозвищем. В южных говорах слово «гина» иногда употребляли в значении «гиблый человек» или «беда», но эта этимология слабая и не подкреплена диалектными словарями. Прозвища с негативным оттенком редко становились основой для фамилий в форме патронимов на -енко, так как эта модель была «семейной» и обычно фиксировала имя отца, а не его характеристику.

Географически фамилия Гиненко тяготеет к Полтавской, Черкасской и Киевской областям. В Российской империи носители фамилии чаще всего числились мещанами или казаками. Сословная принадлежность была разной: от реестровых казаков до сельских священников. Из-за того, что основа фамилии — церковное имя, среди Гиненко было заметно духовенство, но не как исключительное правило, а как естественное следствие того, что имя Евгений часто давали в семьях священнослужителей.

Написание фамилии стабильное — через «и». Вариант «Гыненко» встречается только в старых метрических книгах и связан с особенностями местного произношения (так называемое «ыканье»). В современном русском и украинском языках фамилия пишется одинаково, что облегчает её поиск в архивах.