Фамилия Гизатуллин образована от мужского имени Гизатулла, которое переводится с арабского как «могущество Аллаха» (от слов «гиза» — могущество, сила и «улла» — Аллах). Это имя относится к группе теофорных (божественных) имён, популярных в мусульманской среде, особенно у татар и башкир. Фамилии на -ин в этой традиции формировались по той же модели, что и русские: к основе имени добавлялся суффикс принадлежности. Таким образом, Гизатуллин буквально означает «потомок Гизатуллы».

Интересно, что в отличие от фамилий на -ов или -ев, суффикс -ин в тюркских фамилиях Поволжья встречается реже и часто указывает на более позднее оформление, уже под русским административным влиянием. В данном случае он закрепился за именем, которое само по себе несло высокий религиозный смысл.

Процесс формирования фамилий у татар и башкир был длительным и завершился в основном к концу XIX — началу XX века, поэтому точно определить место возникновения конкретной ветви Гизатуллиных можно только по архивным данным. Однако можно предположить, что предки носителя фамилии были людьми верующими — имя Гизатулла давали в семьях, где особенно чтили религиозные традиции.

Встречаются и варианты написания, например, Гизатулов — с усечением конечного «а» в имени, что характерно для разговорной речи. Но форма Гизатуллин остаётся основной и наиболее распространённой.