Фамилия Гладцына образована от прозвища или мирского имени Гладца. В её основе лежит прилагательное «гладкий». Владимир Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет его как «ровный, не ухабистый, не шероховатый; глаженый, лощеный». Скорее всего, прозвище Гладца указывало на характер человека — спокойный, размеренный, мягкий, без резких углов. Однако это не единственная версия.

В псковских говорах встречается слово «гладец» — «лен, вычесанный напоказ». Если прозвище связано с ним, предок Гладцыных мог заниматься чесанием льна, то есть быть ремесленником, который придавал волокну товарный вид. Ещё одна гипотеза отводит фамилию от мирского имени Гладца, которое восходит к существительному «гладца» — «гололедица». В этом случае имя могли дать ребёнку, родившемуся в пору гололеда, что было распространённой практикой: детей называли по природным явлениям или времени года.

Суффикс -ын указывает на принадлежность: Гладцына — буквально «дочь или жена Гладцы». В русской ономастике фамилии на -ин/-ын обычно образовывались от основ, оканчивающихся на -а/-я. В данном случае исходная форма — Гладца, что подтверждает словообразовательную модель. Форма Гладцына — женский вариант фамилии, но в историческом контексте она могла закрепиться и как фамилия рода в целом, если носителем был человек по имени или прозвищу Гладца.