Фамилия Глотин происходит от прозвища Глота. Его основа — глагол «глотать». В. И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет этот глагол как «проглатывать, поглощать, пропускать сквозь пасть или зев в глотку или пищевое горло и в желудок». Проще говоря, Глотой могли назвать человека с отменным аппетитом.

Но есть и другая версия. В архангельских говорах слово «глот» означало не только «пьяницу», но и «обидчика, притеснителя». Если прозвище имело такой оттенок, то оно могло быть охранительным, внутрисемейным оберегом. Родители нарекали сына Глотой, надеясь, что он вырастет добропорядочным и положительным — в противовес мрачному смыслу прозвища.

Фамилия образована по простой русской модели: к прозвищу Глота добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Глоты). Так потомок человека по прозвищу Глота стал Глотиным.

С. Б. Веселовский в своих работах упоминает родственные именования: крестьянин Фома Глоткин (1473 год, Звенигород) и помещики Глотовы (конец XV века, Новгород). Эти ранние записи показывают, что корень «глот-» был в ходу в разных социальных слоях ещё в средневековой Руси.

Из известных носителей фамилии — Дмитрий Панкратьевич Глотин (род. 1929), инженер космонавтики. Его пример показывает, что фамилия с бытовым, казалось бы, корнем встречается и в сфере высоких технологий.