Фамилия Глушков образована от прозвища, и здесь есть несколько равноправных версий, которые стоит разобрать по порядку. Самая прямая основа — глагол «глушить» с его разными значениями. Прозвище Глушак или Глушко мог получить человек, который глушил рыбу (такой способ ловли был распространён), либо человек буйного нрава, склонный к дракам и «оглушению» противника. Третье значение — «пить спиртное в большом количестве» — тоже могло приклеиться к любителю хмельного.

На Украине и в южнорусских говорах слово «глушко» имело иное значение — так называли глухого человека. Эта версия не противоречит словообразованию, но для фамилии Глушков менее типична, чем для фамилий с суффиксом -енко. Тем не менее, полностью исключать её нельзя, особенно если семья родом из украинских или пограничных губерний.

Фамилия строится по стандартной патронимической модели: к прозвищу Глушко (или Глушак) добавился притяжательный суффикс -ов, означающий «сын Глушка». Форма Глушков закрепилась в русской традиции, тогда как на Украине чаще встречается Глущенко или Глушко без суффикса.

Документальные свидетельства подтверждают древность фамилии. В источниках, собранных историком Степаном Веселовским, упоминаются: Глушко Андрей, крестьянин, начало XVII века, Белёв; Глушков Сидор, крестьянин, 1570 год, Новгород; Глушков Фёдор Данилович, 1595 год, Рязань. Эти записи показывают, что уже в XVI–XVII веках носители фамилии жили в разных регионах — от новгородского севера до рязанского юга, и принадлежали в основном к крестьянскому сословию.

С точки зрения словообразования фамилия Глушков стоит в одном ряду с однокоренными Глушаков, Глущенко, Глушко. Разница в суффиксах указывает на регион: -ов — северно- и центральнорусский, -енко — украинский, -ак — южнорусский. Поэтому по фамилии Глушков можно с большой вероятностью предполагать русское, а не украинское происхождение рода.