Фамилия Глушнюк образована по типичной для западнорусских и украинских земель модели: к основе прозвища или имени прибавили суффикс -ук/-юк, который указывал на принадлежность — чаще всего «сын» или «потомок» того, кто назван в корне. В данном случае корень «глуш-» восходит к слову «глухой». Так могли прозвать человека с ослабленным слухом, но в старых говорах у слова «глухой» был и переносный смысл: глухой лес, глухая деревня, то есть отдалённое, глухое место. Соответственно, Глушнюк — это «сын Глушного», где Глушной — прозвище либо по физическому недостатку, либо по месту жительства в глуши.

Интересно, что фамилия Глушнюк почти не встречается в центральных и северных областях России. Её ареал — преимущественно Волынь, Полесье, западные области Украины и прилегающие районы Беларуси. Суффикс -ук/-юк в этих краях был одним из самых распространённых, он вытеснял великорусские -ов и -ин. Если бы фамилия закрепилась в Московском государстве, она скорее приняла бы форму Глушков или Глухин. По этой региональной примете можно с уверенностью сказать: предки носителя фамилии жили на землях, которые входили в состав Великого княжества Литовского, а затем Речи Посполитой.

Менее вероятная, но не исключённая версия связывает корень с диалектным словом «глушня» — так в некоторых говорах называли глухаря или вообще крупную лесную птицу. В этом случае прозвище Глушня мог получить охотник или человек, чем-то напоминавший эту птицу (например, глуховатый или живущий в лесу). Однако первая версия — от «глухой» — остаётся основной и подтверждается тем, что однокоренные фамилии (Глушко, Глущенко, Глушаков) массово фиксируются именно в значении, связанном со слухом или уединённым местом.

Сословного барьера у Глушнюков не было: эту фамилию могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане. В реестрах Запорожского войска встречаются похожие прозвища, но сама фамилия в документах XVIII–XIX веков чаще попадается среди сельского населения Волынской и Киевской губерний.