Фамилия Глыкин — одна из тех, где внешняя простота обманчива. На первый взгляд кажется, что в основе лежит что-то «глыбастое», тяжеловесное. И это отчасти верно, но не единственная версия.

Словообразовательная модель типична для русского севера и центра: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Глыкин, то есть сын Глыки). Основа — прозвище Глыка. Что оно означало? Тут возможны два основных пути. Первый — от диалектного «глыка»: в некоторых говорах так называли ком, кусок, нечто большое и бесформенное, а также неуклюжего, грузного человека. Прозвище могли дать крепкому, плотному мужчине.

Второй путь — от глагола «глыкать» (глотать, жадно пить). В этом случае Глыкой могли прозвать любителя поесть или выпить, либо человека с характерной манерой речи, «глотающего» слова. Такие прозвища по физическим или поведенческим чертам — самый распространённый источник русских фамилий.

Географически фамилия тяготеет к Верхневолжью и северо-западным областям. Встречается в тверских, новгородских, псковских архивах. Это косвенно подтверждает связь с северными говорами, где слово «глыка» бытовало активнее.

В отличие от фамилий на -ов (от полных форм вроде Иванов), модель на -ин чаще образовывалась от прозвищ с окончанием на -а, -я. Глыкин — типичный пример такого «прозвищного» происхождения. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано — это крестьянская или посадская фамилия, записанная в метрических книгах и ревизских сказках.

Редкая, но правдоподобная гипотеза: в некоторых регионах «глыкой» называли вид речной рыбы (мелкий пескарь или уклейка). Тогда прозвище мог получить рыбак или человек маленького роста — по контрасту с основным значением. Однако эта версия менее подтверждена лексикографически.