Фамилия Гобузов — довольно редкая и, судя по всему, имеет тюркские корни, пришедшие в русскую ономастику через прозвище. Скорее всего, она является фонетическим вариантом фамилии Гопузов, где звонкое «б» заменило глухое «п» под влиянием произношения или диалектных особенностей.

В основе фамилии лежит прозвище Гопуз, а оно, в свою очередь, восходит к нарицательному «гопуз». Этимология этого слова ведет к древнетюркским корням: «гоп» — «высокий, возвышенный» и «уз» — «голос». Вместе это давало значение «волшебное музыкальное звучание». Во многих тюркских языках (например, в казахском, киргизском, турецком) кобыз, кобуз или гопуз — это старинный музыкальный инструмент.

Конкретно гопуз — трехструнный щипковый инструмент, который считается предком современного саза. Его корпус напоминает по строению корпус уда, но значительно меньше по размерам. Изготавливали его методом цельного вытачивания из дерева, причем внешняя сторона на две трети покрывалась кожей, а оставшаяся часть верхней деки оставалась тонким деревянным покрытием. На короткий гриф гопуза навязывали ладки.

Таким образом, прозвище Гопуз мог получить либо музыкант, игравший на этом инструменте, либо мастер, делавший такие кобузы. Суффикс -ов в фамилии Гобузов — стандартный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «сын Гопуза» или «из рода Гопуза». Это типичная модель образования русских фамилий от прозвищ, заимствованных из тюркской среды, что часто встречалось в южнорусских и поволжских регионах, где был тесный контакт с тюркскими народами.