Фамилия Годон — одна из тех, где внешняя простота обманчива. На слух она кажется то ли польской, то ли французской, но её корни, скорее всего, лежат в русской народной среде, а точнее — в прозвищной традиции.

Самый прямой путь к происхождению — через слово «год». В северных и центральных говорах «годон» могли назвать человека, родившегося в удачный, «годный» год, или, наоборот, того, кто долго «годовал» (ждал, выжидал). Но есть и более конкретная версия: в архангельских диалектах «годон» — это сверстник, ровесник. Прозвище могли дать товарищу по возрасту, с которым вместе росли. Такая модель образования (основа + суффикс -он) характерна для русских фамилий, возникших из уличных кличек: сравните с фамилиями Ходон (от «ходить»), Болдон (от «балда»).

Фамилия зафиксирована в документах XVII века. В Ономастиконе С. Б. Веселовского упоминается крестьянин Годон Семенов, живший в 1624 году в Новгородском уезде. Это указывает на то, что фамилия бытовала в северо-западных землях, где прозвища на -он были особенно распространены. Форма без суффикса -ов/-ин (Годон, а не Годонов) — редкая для русских фамилий «непатронимическая» модель, которая сохранилась в основном у старообрядцев или в среде, где фамилии закрепились поздно, прямо из уличного прозвища.

Версия о французском происхождении (от Goudon или Godon) маловероятна для массового русского бытования: носители фамилии Годон встречаются в основном в бывших новгородских и вятских землях, где французское влияние отсутствовало. Польский вариант (Godon) тоже возможен, но тогда фамилия писалась бы через «д» с мягким знаком или имела бы окончание -ский. Таким образом, перед нами типичное русское прозвище, застывшее в форме именительного падежа единственного числа, — редкий случай, когда фамилия не говорит о родстве («чей сын?»), а описывает самого человека, его возрастную или характерную черту.