Фамилия Годжоева образована от персидского мужского имени Ходжа, которое в переводе означает «хозяин, владелец, господин», «обладающий большими знаниями, наставник, учитель». Годжо — кавказский вариант этого имени. Таким образом, потомок человека, которого звали Годжо, со временем получил фамилию Годжоева. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому точно определить время и место происхождения рода Годжоевых можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.