Фамилия Гогулин образована от прозвища Гогуля. В южных говорах слово «гогуля» означало ушиб, опухоль или болячку. Скорее всего, так называли человека, на теле которого было много ушибов и болячек — либо от тяжелой работы, либо от драк. Прозвище было не обидным, а описательным, по внешней примете.

Есть и другая версия. В костромских говорах бытовало слово «гоглиха» — самая мелкая монета. Если прозвище пошло оттуда, то Гогулей называли бедняка, у которого в кармане звенела лишь мелочь. Обе гипотезы правдоподобны, но первая — с телесным недостатком — встречается в русской ономастике чаще, так как прозвища по внешности были самой распространенной группой.

Сама фамилия построена по простой модели: к основе Гогуля добавился патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Гогулин, то есть сын или потомок Гогули. Такая словообразовательная схема типична для русских фамилий, возникших из прозвищ или мирских имен.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и отчасти костромским землям, что подтверждает связь с диалектной лексикой. В документах XVII–XVIII веков можно встретить упоминания крестьян и посадских людей с таким прозвищем, но конкретные даты и имена не сохранились в массовых источниках. Среди известных носителей фамилии нет громких исторических фигур — это рядовая фамилия, типичная для крестьянского и мещанского сословия.

Редкость фамилии в том, что ее корень не связан с церковным именем, а целиком уходит в народную речь. В отличие от фамилий на -ов, образованных от полных крестильных имен, Гогулин — чисто прозвищная фамилия, и ее значение напрямую зависит от того, какой диалект считать исходным.