Фамилия Голенько — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала самой продуктивной на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко изначально указывал на сына или потомка: Голенько — буквально «маленький Голень» или «сын Голеня». Такая форма не требовала дополнительных притяжательных окончаний, поэтому фамилия и осталась неизменной в именительном падеже.

Основа фамилии — прозвище Голень. В прямом смысле «голень» — часть ноги от колена до стопы. Прозвище могли дать человеку с длинными или, наоборот, короткими ногами, с заметной особенностью походки или телосложения. Но есть и вторая, менее очевидная версия: в южнорусских и украинских говорах «голень» иногда означало «голое, безлесое место», «поляну». Тогда прозвище могло относиться к человеку, жившему на открытой местности, или к лысому.

Встречается и фамилия Голенко — без мягкого знака, с тем же корнем. Разница в написании могла возникнуть из-за местных диалектных произношений или ошибок писаря. В целом, Голенько — фамилия нечастая, сосредоточенная преимущественно на территории современной Украины, особенно в Черниговской, Полтавской и Сумской областях. В России она расселилась в результате миграций XIX–XX веков, но осталась редкой.

Сословной привязки у фамилии нет: её носили и казаки, и крестьяне, и мещане. Суффикс -енко не указывает на знатность, в отличие от польских -ский/-цкий. Это типичная демократическая украинская фамилия, образованная от бытового прозвища, — ничего аристократического, зато живая связь с языком и повседневностью предков.