Фамилия Голишикова — женская форма фамилии Голишиков, которая в свою очередь происходит от прозвища или нецерковного имени. Основа «Голиш» — это диалектное или просторечное слово, которое могло обозначать человека с большой, заметной лысиной (от «голый»). В русских говорах встречаются слова «голиш» (лысый) и «гольш» (бедняк, голытьба), так что у фамилии может быть два смысловых оттенка: либо внешний признак — лысина, либо социальный статус — бедный, неимущий человек. Второй вариант менее вероятен, потому что прозвища по бедности обычно образовывались через суффиксы -як или -ух (голяк, голух), а -иш характерен для прозвищ по физическим особенностям.

Суффикс -ик в основе «Голиш» — это уменьшительно-уничижительный или просто разговорный формант, который в русской антропонимии встречается нечасто. Обычно прозвища на -иш (Голиш) становились основой для фамилий через притяжательные суффиксы -ов или -ин. Здесь мы видим модель «Голиш + -ик + -ов»: сначала прозвище Голиш, потом его расширение до Голишик («маленький лысый» или «сын лысого»), и уже от этой формы образована фамилия. Такая цепочка — редкий пример осложнённого суффиксального наращения, когда к основе добавляют два суффикса подряд. В словаре Б. Унбегауна подобные модели не выделяются отдельно, но в реальной ономастике встречаются, особенно в северных и центральных регионах России.

Географически фамилия Голишиков (и её женская форма) тяготеет к Поволжью и Уралу: по данным современных телефонных справочников, большинство носителей живут в Пермском крае, Свердловской и Нижегородской областях. Это косвенно подтверждает диалектную природу прозвища — в северных говорах слово «голиш» фиксируется чаще, чем в южных. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они были крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами: фамилии на -иков не характерны для высших сословий, где преобладали -ов и -ин без промежуточных суффиксов.

Окончание -а в Голишикова указывает на женскую форму, которая в русской традиции XIX — начала XX века была патронимической: дочь или жена Голишикова. Сама фамилия не имеет вариантов написания с буквой «ы» (Голышикова) — это отдельная фамилия от «голыш» (голый камень, мелкая рыба или голый человек), но по звучанию они близки, и их иногда путают. Однако Голишикова — самостоятельное образование, а не описка.