Фамилия Голоскубов образована по самой распространённой в русской ономастике модели — от прозвища с помощью суффикса -ов. Но её основа необычна и сразу привлекает внимание: в ней слышен глагольный корень «голо-» (от «голый», «голить») и «скуб-» (от «скубать», то есть драть, щипать, обдирать). В старых говорах «голоскуб» — прозвище человека, который «голо скубёт», то есть обдирает, обирает дочиста. Скорее всего, так называли либо крайне бедного человека, у которого «нечего скубнуть», либо, напротив, прижимистого и жадного, который сам всё до нитки обирает.

Версия о том, что прозвище дали за привычку ходить небритым или с редкой бородой («голо скубётся» — плохо, скудно растёт волос), менее убедительна: глагол «скубать» в этом контексте почти не встречается в диалектах. Правдоподобнее, что прозвище носило бытовой, насмешливый оттенок и относилось к скупости или бедности.

Фамилия редкая, сконцентрирована в основном в центральных и южнорусских областях, особенно в бывшей Курской губернии. Встречается и в украинских говорах, где «скубати» означает «щипать», а «голоскубий» — «голощіп», то есть человек, ощипывающий птицу наголо. Это могло быть прозвищем птичника или торговца птицей, но для русского уха звучит скорее как прозвище за характер.

В отличие от фамилий на -ский (Голоскубский), которые часто указывали на географическое происхождение, Голоскубов — чисто русская патронимическая фамилия от прозвища. Её носители, судя по архивным записям XIX века, были в основном крестьянами и мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её «низовое» происхождение — от меткого, нелестного, но живого прозвища.