Фамилия Голушонкова — женская форма фамилии Голушонков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Голушонок. Ключ к пониманию фамилии — в редком суффиксе -онок, который в русских фамилиях встречается нечасто. В белорусском, украинском и севернорусском говорах этот суффикс указывал на молодое существо, детёныша: волчонок, лисёнок. Соответственно, Голушонок — это «маленький Голый» или «сын Голого». Так могли назвать младшего в семье, ребёнка, который, в отличие от отца, ещё не обзавёлся хозяйством и «гол как сокол», то есть беден.

Основа «гол-» в русских прозвищах многозначна. Помимо прямой бедности, она могла означать лысого человека (голова, лишённая волос) или того, кто ходит в рваной, «голой» одежде. В северных и сибирских говорах «голухой» называли протоптанную тропу, а «голью» — бедняков. Таким образом, Голушонков — это не столько характеристика конкретного человека, сколько указание на его происхождение: сын бедняка, сын лысого или сын человека по прозвищу Голый.

Географически фамилия тяготеет к западным и северным регионам России. Суффикс -онок типичен для смоленских, брянских, псковских и новгородских земель, где в XV–XVII веках активно использовалась патронимическая модель «имя + онок» (например, Ивашонок, Федосёнок). В отличие от массовых -ов и -ин, фамилии на -онок реже проникали в дворянские родословные и чаще оставались в крестьянской и мещанской среде.

В написании Голушонкова сохранилась историческая черта: в отличие от фамилий на -ёнок (например, Козлёнков), здесь стоит -онок. Это указывает на твёрдое произношение корня: не «голушёнок», а «голушонок», что роднит фамилию с диалектными формами типа «голышонок» — голый птенец, ещё не оперившийся. Вероятно, прозвище дали человеку, который в детстве или юности был настолько худ и беден, что напоминал неоперившегося птенца.

Других версий, объясняющих фамилию через тюркские или финно-угорские корни, нет — основа «гол-» здесь прозрачно славянская. Фамилия не относится к числу редчайших, но и широкого распространения не получила: носительницы Голушонковой чаще всего встречаются в Смоленской, Тверской и Ленинградской областях, что подтверждает её северо-западное происхождение.