Фамилия Гончурин — это типичный пример «вторичной» русской фамилии, образованной от прозвища или имени Гончура с помощью патронимического суффикса -ин. Суффикс -ин в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — Гончурин, то есть сын Гончуры. Сама основа Гончур- звучит нехарактерно для исконно славянских имен, и это сразу подсказывает, что прозвище было непростым.

Наиболее вероятное объяснение связывает прозвище Гончура со словом «гончий». В старину «гончими» называли не только породу собак, но и всё, что связано с быстрым преследованием, погоней. Гончурой могли прозвать скорохода, гонца, который разносил вести, или же человека, который разводил и тренировал гончих собак для охоты. В охотничьем быту такие люди ценились высоко, и прозвище могло стать наследственным. Также не исключено, что прозвище относилось к охотнику-псарю, который ходил с гончими.

Менее правдоподобна, но всё же заслуживает упоминания версия о связи с немецким словом Gans («гусь»). Согласно этой гипотезе, фамилия Гончурин могла возникнуть как русифицированный вариант еврейской или немецкой фамилии Гончур (Гонсер), которую давали птицеводу, разводившему гусей. Однако эта теория слабее: во-первых, фонетический переход Gans → Гончур неочевиден и требует дополнительных допущений, а во-вторых, для русских фамилий гораздо естественнее связь с местной лексикой и промыслами, чем заимствование из идиша или немецкого через еврейскую среду, которое было редким и обычно сохраняло исходное звучание.

Таким образом, с большой долей уверенности можно говорить, что предок носителей фамилии Гончурин был либо быстрым гонцом, либо охотником, державшим гончих. Фамилия закрепилась в форме с суффиксом -ин, что характерно для северных и центральных областей России, где такие прозвища переходили в фамилии особенно активно.