Фамилия Гонтуар — редкая и нестандартная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а французское или, шире, западно-европейское. В исконно русских фамилиях мы привыкли к суффиксам -ов, -ин, -ский, а здесь — чистый корень, закончившийся на -ар, что сразу выдаёт иностранное влияние.

Наиболее вероятная версия: Гонтуар — это русифицированная форма французской фамилии Gont(h)ier или Gonthier. В основе лежит древнегерманское имя Gundahar (от gund — «битва» и hari — «войско»), которое через латынь и французский язык дало такие варианты, как Гонтье, Гонтье, Гонтуар. В Россию такая фамилия могла попасть вместе с французскими эмигрантами, гувернёрами, офицерами или мастерами в XVIII–XIX веках, когда дворянство охотно приглашало иностранцев. Не исключено также, что это потомок французского колониста, осевшего в Причерноморье или в Москве.

Менее вероятна, но возможна версия о связи с тюркскими или кавказскими языками, где «гонтуар» могло бы означать что-то вроде «серый» или «медный» (от «гён» — цвет, «туар» — металл). Однако для этого нет убедительных лингвистических параллелей, а написание фамилии слишком точно совпадает с французскими аналогами.

Географически носители фамилии Гонтуар в России встречаются единично, в основном в крупных городах. По сословной принадлежности предки, скорее всего, были либо дворянами (обрусевшими иностранцами), либо городскими ремесленниками или торговцами. В любом случае, это яркий пример того, как европейское имя превратилось в русскую фамилию, сохранив свою звуковую форму без типичных славянских суффиксов.