Фамилия Горбышин — редкий пример, когда суффикс -ин прирос не к прозвищу, а к топониму. Вопреки первому впечатлению, в основе лежит не слово «горб» в значении физического недостатка, а название населённого пункта — Горбыши. Такие деревни встречались в Псковской и Смоленской губерниях, а также на севере Беларуси. Человек, переехавший из Горбышей, получал прозвище Горбыш, а его потомки становились Горбышиными.

Притяжательный суффикс -ин здесь работает как в фамилиях от личных имён (Ильин, Пушкин), но указывает не на отца, а на место жительства: «кто из Горбышей». Это так называемая топонимическая модель, характерная для северо-западных русских земель. Если бы основа была прозвищем, мы бы скорее ждали фамилию Горбов или Горбачёв — с суффиксом -ов.

Само название деревни Горбыши, скорее всего, произошло от диалектного слова «горбыш» — так в некоторых говорах называли холмик, бугор, возвышенность. Не исключена и связь с личным именем Горб (известным по древнерусским грамотам), но в данном случае топонимическая версия надёжнее: слишком много одноимённых деревень на карте.

Сословного барьера у фамилии не было. Горбышины могли быть и крестьянами, и мещанами, и духовенством — в зависимости от того, кто и когда покинул родовую деревню. Встречается она редко, в основном в центральных и северо-западных областях России, что подтверждает её локальное происхождение.

Словообразовательно фамилия проста: корень горб- + суффикс -ыш (уменьшительно-пренебрежительный или указывающий на предмет) + фамильный -ин. Похожая модель — у фамилий Малышин, Голышин, где основа тоже заканчивается на -ыш.