Фамилия Горонинов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка не связано с тем, что кажется очевидным. Первое, что приходит в голову — «гора» или «горе», но ни один из этих корней не даёт убедительного объяснения. Слово «гора» в прозвищах обычно приобретает форму Горовой или Горский, а «горе» — Горемыкин или Горюнов. Горонинов стоит в стороне.

Вероятнее всего, перед нами вариант фамилии, образованной от неканонического имени или прозвища Гороня. Это имя могло возникнуть от глагола «горонить» — в некоторых южнорусских говорах так говорят о человеке, который говорит громко, басисто, «горонит», то есть издаёт низкий, раскатистый звук. Прозвище Гороня могли дать обладателю мощного, густого голоса. Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Горонин, то есть сын или потомок Горони. Форма Горонинов — это уже патроним второго порядка: «внук Горони». Такая модель встречается реже, чем простая на -ов/-ин, и часто указывает на более позднее закрепление фамилии в некоторых регионах, особенно в центральных и южных губерниях России.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «горон» — так в некоторых местах называли жёлудь или небольшой круглый предмет. Но это предположение слабее, так как прозвища по форме предмета обычно давали с уменьшительными суффиксами (Горошек, Жёлудев), а не в форме Гороня.

Что касается географии, фамилия Горонинов встречается точечно, в основном в документах XIX века по Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниям. Это подтверждает связь с южнорусской диалектной зоной, где слово «горонить» было в ходу. Предки современных Горониновых, скорее всего, были крестьянами или однодворцами из этих мест, и фамилия закрепилась за их родом без изменений уже к середине XIX века.