Фамилия Гречушенко — яркий пример украинской модели фамилии, где суффикс -енко указывает на происхождение от отца или на принадлежность к роду. В данном случае основа — Гречуш(а), а суффикс -енко буквально значит «сын Гречуши» или «потомок Гречуши». Такая модель была особенно распространена в Левобережной Украине и на Слобожанщине, где фамилии на -енко стали массовыми уже в XVII–XVIII веках.

Корень фамилии восходит к слову «гречка» (греча). Исходное прозвище Гречуша могли дать человеку, который либо выращивал гречиху, либо торговал ей, либо был особенно заметен на фоне остальных — например, из-за смуглого цвета лица или волос, напоминающих цвет гречневой крупы. На Украине и юге России гречка была одной из главных сельскохозяйственных культур, поэтому прозвища от неё не редкость.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий Гречко или Гречанинов, форма Гречушенко сохранила уменьшительно-ласкательный суффикс -уш- в основе. Это придаёт фамилии оттенок прозвища, данного, вероятно, в бытовом, семейном кругу: Гречуша — не просто «гречневый человек», а скорее «гречушка», «гречневый малый». Такие формы часто возникали в казацкой среде, где прозвища были живыми и образными.

Географически фамилия Гречушенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черниговщине, Сумщине. В России она встречается реже, преимущественно среди потомков переселенцев из этих регионов. Вариант написания с «ё» (Гречушёнко) — возможная орфографическая адаптация, но в документах устойчиво закрепилась форма через «е».

Других версий происхождения, кроме прозвищной от «гречки», у фамилии нет — она прозрачна по структуре и семантике. Сословно носители Гречушенко, скорее всего, относились к казакам или крестьянам, а не к дворянству: фамилии на -енко в большинстве своём демократичны по происхождению.