Фамилия Губачеков происходит от прозвища Губачек. В основе лежит слово «губа», но вот что оно означало в конкретном случае — вопрос открытый. Самое прямое объяснение — внешность: «губа» как часть лица. Прозвище Губачек могли дать человеку с заметными, полными губами. Но у слова есть и переносный смысл: «губы дуть» — обижаться. Тогда прозвище могло закрепиться за обидчивым, капризным человеком.

Интереснее другая версия, которую часто упускают. В старину «губа» — это не только рот, но и административная единица: судебный округ, волость. Было даже понятие «губной староста» — выборный глава местного самоуправления. Если прозвище Губачек образовали от этого значения, то оно могло указывать на владельца крупного хозяйства, целой «губы», или на человека, жившего на границе такого округа. Здесь же — «губа» в значении «морской залив», что тоже возможно для жителей побережий.

Фамилия образована по типичной восточнославянской модели: к основе Губачек прибавили суффикс -ов. Суффикс указывает на принадлежность: Губачеков буквально означает «сын Губачека». Сама же уменьшительная форма Губачек (с суффиксом -ек) в прозвищах могла означать либо маленькую «губу» в прямом смысле, либо ласкательное или ироничное именование взрослого человека.

Какая из версий правдоподобнее? Первая, с внешностью или обидчивостью, встречается чаще и понятнее для крестьянской среды, где прозвища давали по заметным чертам. Однако версия с «губой»-округом не менее реальна — она отсылает к социальному статусу предка, что для фамилий не редкость. Скорее всего, в разных семьях Губачековых основа прозвища могла быть своей.