Фамилия Губачев (и её вариант Губачёв) происходит от прозвища Губач. Самая прямая версия — внешняя: так могли назвать человека с пухлыми, крупными губами. Но есть и другой, бытовой оттенок: «надуть губы» — обидеться, поэтому прозвище Губач могло закрепиться за обидчивым, капризным человеком.

Менее очевидная, но живая версия связана с грибами. В народе некоторые грибы называли «губами» или «губачами» — например, трутовик или маслёнок. Тогда Губач — это грибник, знаток грибных мест.

Слово «губа» в русских говорах означало не только часть лица, но и «округ», «волость», «усадьбу» (отсюда «губной староста»). Если предок жил на отшибе, владел большим двором или его селение стояло на берегу залива (губы), его вполне могли прозвать Губач.

Суффикс «-ев» в фамилии указывает на принадлежность: сын Губача, потомок человека с таким прозвищем. Это типичная патронимическая модель для русских фамилий.

Спор между окончаниями «-ёв» и «-ев» — вопрос письменной традиции. В советских паспортах часто писали «Губачев» без ё, но произносить могли и через «ё». Оба написания обозначают один род.

Другие фамилии с тем же корнем — Губин, Губкин, Губанов, Губатый. Но Губачев выделяется именно суффиксом «-ач», который в древнерусском языке часто образовывал прозвища по яркому признаку (ср. Усач, Бородач, Глазач). В ономастике это типичная модель для «говорящих» прозвищ.

Географически фамилия встречается в центральных и северных областях России — там, где слово «губа» в значении «залив» было в ходу, и где активно собирали грибы-губачи. Точно сказать, какая из версий верна для конкретного рода, можно только по семейным преданиям, но все они ведут к одному выводу: предок был заметным человеком — либо внешне, либо нравом, либо родом занятий.