Фамилия Губоренкова — женская форма фамилии Губоренков, и её разбор стоит начать с неочевидного на первый взгляд корня. Вопреки возможному желанию связать её с глаголом «губить» или словом «губа», основа здесь, скорее всего, прозрачна, но редка: «губор» — диалектное или профессиональное прозвище. В русских говорах «губорить» означало «говорить, болтать, тараторить» (ср. с «гуторить»). Человек, которого прозвали Губор, — говорливый, бойкий на язык, возможно, балагур или затейник. Суффикс -енк- в основе «Губоренк-» указывает на восточноукраинское или южнорусское происхождение: в этих регионах фамилии на -енко (Губоренко) особенно распространены, а добавление -ов в русской адаптации дало Губоренков, то есть «сын Губоренка», внук Губора.

Модель образования фамилии двойная: сначала прозвище Губор превратили в патроним Губоренко (уменьшительно-ласкательная форма «маленький Губор» или «сын Губора»), а затем, при переходе в великорусскую среду, добавили типичный русский суффикс -ов. Таким образом, Губоренкова буквально — «жена (или дочь) Губоренкова». Такая цепочка характерна для фамилий, возникших на стыке украинской и русской антропонимических традиций, особенно в Слобожанщине, на Кубани и в южных уездах России, куда переселялись малороссы.

Версия о происхождении от топонима маловероятна: на картах не зафиксировано поселений с названием Губоры или Губоренки. Также сомнительна связь с «губернатор» — слишком сильное фонетическое искажение. Наиболее правдоподобно именно прозвищное происхождение от «губорить»: фамилия могла закрепиться за родом, где предок славился красноречием или, напротив, излишней болтливостью.

Окончание -ова типично для женской формы, и в современных справочниках фамилия встречается именно в таком виде — у женщин, тогда как мужчины носят Губоренков. Фамилия редкая, не входит в списки ста наиболее частых русских фамилий, что говорит о её локальном бытовании — возможно, в пределах одной-двух областей. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и казаками (на юге прозвища давались легко и часто переходили в фамилии), но точных данных о принадлежности к дворянству нет.