Фамилия Гусейновы — одна из тех, что прямо указывает на имя родоначальника. В её основе лежит азербайджанский вариант арабского имени Хусейн, которое означает «хороший» и связано с ранним периодом ислама. Словообразовательная модель проста: к имени Гусейн добавили русский патронимический суффикс -ов, и получилось «сын Гусейна» или «потомок Гусейна». Такая схема типична для фамилий, которые формировались у тюркских народов в XIX–XX веках под влиянием русской административной системы, когда фиксировали имя отца как родовое прозвание.

В дореволюционных документах носители фамилии встречаются в разных сословиях. Например, в Книге памяти Хабаровского края записан директор кирпичного завода Азис Аминович Гусейнов, родившийся в 1881 году в Биробиджане. В Книге памяти Самарской области — Абиль Ахмед-оглы Гусейнов (р. 1908) из Куйбышева. А в Алтайском крае упоминается кустарь-лудильщик частной мастерской Александр Сергеевич Гусейнов (р. 1866) из Барнаула. Эти записи показывают, что фамилия не была привязана к одному региону или занятию: её носили и управленцы, и ремесленники, причём в разных частях страны.

Версия о том, что фамилия восходит к выходцам из Золотой Орды — печенегам или половцам, — выглядит натянутой. Имя Хусейн имеет арабское, а не тюркское происхождение, и широкое распространение в Закавказье и на Ближнем Востоке оно получило вместе с исламом, а не с кочевыми племенами. Поэтому связывать Гусейновых с домонгольскими тюрками нет оснований: фамилия скорее отражает более поздние миграционные процессы, когда азербайджанцы и другие мусульманские народы оказывались на территории Российской империи.

Самый известный носитель фамилии — азербайджанский писатель Чингиз Гусейнов, автор романов «Магомед, Мамед, Мамиш...» (1975) и «Семейные тайны». Его творчество хорошо известно, но это лишь одна ветвь большого родового древа. Окончательно говорить о времени и месте возникновения конкретной линии Гусейновых можно только после серьёзного генеалогического исследования, потому что процесс формирования фамилии у разных семей мог идти в разное время и в разных местах.