Фамилия Гусятникова образована от прозвища Гусятник. В основе лежит нарицательное слово «гусятник» — так в старину называли человека, который пас гусей или торговал ими. Это типичное «профессиональное» прозвище, указывающее на род занятий предка. Словообразовательная модель проста: к основе Гусятник- добавлен суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Гусятника), а затем фамилия обрела окончание -а, характерное для женского рода. Изначально Гусятниковой называли жену или дочь Гусятникова, но сейчас это самостоятельная фамилия, которая пишется одинаково для всех женщин.

Прозвище Гусятник встречается в письменных источниках с XVI века. Историк С. Веселовский упоминает Гусятниковых — гостей (купцов, ведущих крупную торговлю) в Москве в XVI–XVII веках. Это значит, что предки носителей фамилии не обязательно были пастухами или мелкими торговцами: среди них встречались и состоятельные люди, входившие в купеческую элиту. Такая социальная деталь — редкость для фамилии, образованной от бытового прозвища, и добавляет ей исторической глубины.

Само прозвище могло закрепиться и за человеком, который разводил гусей, — гусятники были распространены в крестьянском хозяйстве. В некоторых говорах «гусятником» называли также любителя гусиных боев, но эта версия менее вероятна для основы фамилии. Главное, что объединяет все варианты, — связь с гусями, птицей, игравшей заметную роль в быту и торговле Древней Руси.