Фамилия Гындынов — редкий случай, когда географическая привязка оказывается важнее, чем разбор корня. Основной ареал фамилии — Бурятия и соседние регионы Восточной Сибири, что сразу указывает на её вероятное происхождение от бурятского или монгольского имени. В русской традиции такие фамилии часто образовывались по стандартной модели: к иноязычной основе добавляли русский суффикс -ов, реже -ин, чтобы адаптировать имя под паспортную систему.

Основа «Гындын» восходит к бурятскому мужскому имени Гындын (Гандан), которое, в свою очередь, происходит от тибетского dga’ ldan — «радостный», «блаженный». В буддийской традиции это название небесной обители, райской сферы. Имя было распространено среди бурят-ламаистов, особенно в XIX — начале XX века, когда тибетские имена активно заимствовались через монгольское посредничество. Таким образом, Гындынов — это «сын Гындына», где суффикс -ов работает как притяжательный, указывая на принадлежность к отцу.

Словообразовательная модель здесь классическая для русификации нерусских имён: от основы (Гындын) отсекается окончание, добавляется -ов. Аналогичные примеры — фамилии Баторов, Цыренов, Доржиев. Интересно, что в бурятском языке ударение в имени падает на первый слог (Гы́ндын), тогда как в русской фамилии оно сместилось на последний: Гындыно́в. Такое смещение типично при адаптации: русское ухо привыкло к ударному суффиксу в фамилиях.

Версия о тюркском корне (например, от «гынды» — «скряга» в некоторых диалектах) маловероятна и не подтверждается географией: фамилия почти не встречается в тюркоязычных регионах. Точной даты возникновения фамилии нет, но, скорее всего, она оформилась в конце XIX века, когда у бурят начали массово фиксировать фамилии по отцу. Носители фамилии — потомки людей, носивших имя Гындын, возможно, лам, скотоводов или крестьян.