Фамилия Ибаковский образована от мужского имени Ибак — производной формы арабского имени Ибрагим (библейский Авраам, «отец народов»). По модели это отчество второго порядка: Ибаковский буквально означает «сын Ибакова, внук Ибака». Суффикс -ский указывает на дворянское или шляхетское происхождение: в XV–XVII веках такие фамилии часто закреплялись за служилыми людьми, выходцами из Орды или татарских княжеств, переходившими на русскую службу.

Корни рода, скорее всего, уходят в среду тюркской или татарской знати. Известен татарский царевич Ибак, который во второй половине XVI века находился на русской службе. Не исключено, что именно он стал родоначальником Ибаковских. Проникновение таких фамилий в русскую среду — обычное дело для того времени: многие дворянские роды России вели начало от половецких, печенежских или ордынских переселенцев, принимавших православие и поступавших на государеву службу.

Точное место и время возникновения рода можно установить только через углублённые генеалогические разыскания — по писцовым книгам, разрядным спискам и родословным росписям. Но уже сейчас ясно, что фамилия Ибаковский — не случайный осколок прошлого, а прямой след контакта восточной и русской культур, зафиксированный в языке и дворянских хрониках.