Фамилия Ибниаминов — редкий пример того, как арабская именная формула превратилась в русскую фамилию. В её основе лежит восточное мужское имя Ибниамин, которое само по себе составное: первая часть «ибни» переводится как «сын», а вторая — «Амин» — означает «надёжный, честный, верный; хранитель, страж». Вместе имя Ибниамин осмыслялось как «надёжный сын». Скорее всего, так называли мальчика в семье, где ценили верность и честность, или же это было пожелательное имя.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для обрусевших восточных имён: к основе Ибниамин добавили русский патронимический суффикс -ов. Такой способ образования фамилий был особенно распространён в среде крещёных татар, башкир и других народов Поволжья, а также среди горских народов Кавказа, принявших православие. Фамилии на -ов от арабских имён — не редкость (сравните Ибрагимов, Исмаилов), но случай Ибниаминов выделяется тем, что исходное имя образовано от арабского слова «ибн» («сын»), которое обычно входит в состав сложных арабских имён (например, Ибн Сина). Здесь же оно стало самостоятельной частью имени, что встречается гораздо реже.

Поскольку фамилия явно не массовая, её географию можно связать с регионами, где традиционно жили тюркские или кавказские народы, испытавшие влияние арабской культуры и ислама, а затем — русской административной системы. В метрических книгах XIX века такие фамилии чаще всего фиксировались у татар-кряшен (крещёных татар) и у народов Северного Кавказа. Точных данных о сословной принадлежности носителей фамилии нет, но, судя по модели образования, предки Ибниаминовых были, скорее всего, крестьянами или мещанами — фамилии на -ов в дворянской среде из восточных имён почти не встречались.

В написании фамилии иногда встречается вариант Ибниаминов (с одной «н») — это связано с тем, что в русской транскрипции арабское «ибн» на письме могло упрощаться. Однако двойное «н» в суффиксе — норма для русского языка, и именно такой вариант закрепился в документах. Фамилия не имеет отношения к еврейским именам (несмотря на созвучие с Биньямин): её корни чисто арабские, а путь в русскую ономастику — через тюркское или кавказское посредничество.