Фамилия Игнахин образована от производной формы крестильного имени Игнатий. В переводе с латинского это имя означает «огненный», хотя существует и более редкая версия — «неведомый». В обиходе полное имя сокращали, и в народной среде закрепился вариант Игнаха — от него и пошла фамилия. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Игнахин буквально значит «сын Игнахи» или «потомок Игнахи».

Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а или -я. Сравните: Игнатов (от Игнат) и Игнахин (от Игнаха) — разница в суффиксе, но корень общий. Сама форма Игнаха звучит простонародно, что выдаёт крестьянское или мещанское происхождение первых носителей: в дворянской среде предпочитали полное имя Игнатий или его вариант Игнат.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, особенно к Архангельской, Вологодской и Костромской губерниям, где уменьшительные формы на -аха были особенно распространены. Встречается она и на Урале, куда переселенцы принесли её в XVII–XVIII веках.

Таким образом, предки современных Игнахиных — это люди, носившие обиходное имя Игнаха, а их фамилия — прямое указание на отчество, застывшее в официальном документе. Никакой связи с ремёслами или прозвищами здесь нет: основа чисто антропонимическая.