Фамилия Игнатикова образована от мужского крестильного имени Игнатий, которое в переводе с латинского означает «огненный» (по другой версии — «неведомый»). В основу фамилии легла не полная, а производная, уменьшительная форма имени — Игнатик. Такая модель словообразования типична для русских фамилий: суффикс -ик в имени указывал на ласковое или обиходное обращение, а затем стал основой для фамильного прозвания. Суффикс -ов- в окончании фамилии (Игнатиков) указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Игнатика». Женская форма Игнатикова, соответственно, означает «дочь или жена Игнатикова».

Скорее всего, основатель рода Игнатиковых был выходцем из рабочей или крестьянской среды. В среде духовенства и дворянства предпочитали полные, торжественные формы имени (Игнатьев, Игнациев), а уменьшительные варианты вроде Игнатик были распространены именно в простонародье. Таким образом, потомок человека, которого в быту звали Игнатик, со временем получил фамилию Игнатикова.

Фамилия эта встречается реже, чем распространённая Игнатьев, что делает её более локальной. Географически она тяготеет к центральным и южным областям России, где имя Игнатий было особенно популярно в XVII–XVIII веках. В написании с окончанием -ова (а не -ева) нет ничего необычного: твёрдый согласный основы (Игнатик) даёт именно такое окончание в женском роде.