Фамилия Игнатухина образована от женского варианта мужской фамилии Игнатухин. Её основа — прозвище или неофициальное имя Игнатуха. Это характерный для русских говоров вариант крестильного имени Игнатий (от латинского «ignis» — огонь). В народной речи имя упрощали: Игнат, Игнатка, Игнатуха. Суффикс -ух- здесь не уменьшительно-ласкательный, а скорее фамильярно-бытовой, как в именах Петруха, Митюха. Такая форма показывала, что человека в семье или в деревне звали запросто, по-свойски.

Фамилии на -ин, как Игнатухин, в русской традиции указывали на принадлежность: «чей?» — «Игнатухин», то есть сын или дочь Игнатухи. Женская форма Игнатухина в документах обычно закреплялась за женщиной, но в быту могла обозначать и жену Игнатухина. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречались у служилых людей и в центральных областях, фамилии на -ин распространены в северных и северо-восточных регионах России, а также в Поволжье. Игнатухины могли быть крестьянами или посадскими людьми, жившими в Архангельской, Вологодской или Вятской губерниях — там такие формы имени бытовали особенно часто.

Редкость фамилии в том, что она сохранила архаичную суффиксальную модель. Многие однокоренные фамилии — Игнатов, Игнатьев, Игнатенко — образованы от более стандартных форм имени, а Игнатухин стоит особняком, напоминая о живой разговорной стихии. Если ваш предок носил эту фамилию, он, скорее всего, происходил из среды, где ценили неофициальные, «домашние» варианты имени, а сам Игнатий в его роду был, вероятно, заметной фигурой — возможно, основателем крестьянского двора или ремесленником.